在牛顿的一 中，母亲的这个祷告对于他的个性与信仰他有很深刻的影响。牛顿在成长过程留下的最早记录就是他的祷告，他经常在课堂笔记空白处记下祷告，例如在一六六二年，他大学二年级时写下：

上帝啊！ 若我心偏于邪恶，请勿成全我；

不容我单靠自己的信念去生活；

不以爱上帝做为我不爱人的籍口；

不是为得祝福来跟随你；

不是只在教会中渴慕你；

让我做个敬畏你的人，

且因著敬畏你，

而不畏惧人。

牛顿经常思索上帝当年听他母亲的祷告，上帝让他活下来一定有些事是要他去完成的。到牛顿三岁时，因为家里实在太穷，母亲只好再嫁给邻村一位六十三岁的鳏夫----- 巴拿巴·史密斯牧师。史密斯牧师靠著微薄的薪水把牛顿养大，八年后过世，母子俩领了一些辅恤金，牛顿下课后还要替人看牛管马才够生活。