《多马福音》的科普特语（Coptic）版本于1945年在埃及的拿哈玛地（Nag Hammadi）发现。1945年12月，一个名叫穆罕默德．阿里的阿拉伯农夫，在挖土施肥的时候，发现了一红色陶罐，地点是在埃及北边的拿哈玛地(Nag Hammadi)城。打开后发现的竟是十三卷以皮革装订的纸草古卷。这些古抄本，有一部份文字被烧毁或遗失，不过在经历许多年非法盗卖、暴力、走私以及学术竞争等劫难，仍然有五十二份文件得以还原面世。在拿哈玛地发现的文件先是单独或数篇合订初版，直到1977年才有全集以英文通行本发行。这本全集在1988年以《拿哈玛地文库》之名再版。

     当《多马福音》的科普特语（Coptic）版本内容被翻译出来以后，考古学家才意会到早在1898年之时，其希腊文部份原文已在俄西林古Oxyrhynchus( “俄西林古”一译“奥斯莱卡”，Oxyrhynchus,是位于上埃及尼罗河西岸法雍以南的的古城.1897和1903年Dr.Grenfell和Dr.Hunt曾在该地发现古代纸草卷)出土，相信是拿哈玛地（Nag Hammadi）版本的古本。根据考古学家推断，希腊文版本应在约公元200年成书，而科普特语版本则在公元340年左右。

    《多马福音》是二十世纪圣经学上的一个重大发现：因为《多马福音》的发现，间接支持了现代新约圣经传译学的一则重要论证。这项论证揣断，马太福音和路加福音重叠的部分是来自同观语录源（Sypnotic Sayings Source，或称Q来源 — [Q Source]，“Q”代表德文Quelle，意即“来源”）。

    《多马福音》和四福音书的最大分别，在于多马福音除了声称是由耶稣的十二位门徒之一的多马所写以外，全卷书只是记了耶稣的语录，并没有提及他的生平。而且有部份内容是多马福音独有的。根据内容推断，多马福音的最初成书日期约在公元60年，比现时四福音书成书最早的马可福音还要早，语录体的《多马福音》的出现证明了多年来学术界所猜想的早期口传福音Q资料的确实存在。过去曾经有人认为多马福音是是后人所写而假托古人之名的伪经。但是也有不同意见，比如美国乔治城大学的娄世钟先生在《耶稣灵道论语多玛斯福音》一书中指出，这份文件有许多犹太人的口语用法，文字对仗显得比正典福音完整，符合当初犹太人喜好对称性的说话方式，以“天父之国”或“天堂之国”来称呼“天国”可见作者十分熟悉耶稣和犹太人的用语。金陵协和神学院的田童心先生在2003年出版的《神学的觉悟》一书中就认为应当把《多马福音》与诺斯替（灵智派）玄学思想作一个区分，《多马福音》的思想其实具有宝贵的人文主义价值。《拿哈玛地文库》（拿戈玛第经集）的发现革命性地改变了以往对于早期基督教会的研究主要依据教父文献的局面。它有可能唤醒原来四部福音书里那些隐约呈现的人文主义信仰信息，使得福音书里所记的出自耶稣之口的比喻故事中的相当部分释放出了崭新的积极蕴涵。根据孙善玲先生研究，目前学术界已经接受由格言组成的《多马福音》为经典，而其他早期福音书尚未被认可。《多马福音》已经被美国数百位新约圣经学者加盟的“耶稣研究会”列为值得信赖的关涉耶稣信仰的“第五福音”，1996年他们出版了《五福音》（The Five Gospels）。

     2006年9月27日，教宗本笃十六对于在《若望(约翰)福音》中耶稣与多默(多马)宗徒互动的言谈有一则分享性的感人评论。教宗并对《多默(多马)福音》和《多默(多马)行传》有正面的提示，他指出“对基督信仰团体的起源，这两份文献是很重要的研究资料”。

《多马福音》中文译本内地公开版